Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc46a3Q9DC26 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc46a3Q9DC26 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms