Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Alkbh4Q9D8F1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Alkbh4Q9D8F1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms