Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D5Q8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D5Q8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9D5Q8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9D5Q8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D5Q8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D5Q8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D5Q8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D5Q8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D5Q8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D5Q8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D5Q8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9D5Q8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9D5Q8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D5Q8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D5Q8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D5Q8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms