Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc105Q9D4K7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc105Q9D4K7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.5 ms