Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrp2bpQ9D4C6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrp2bpQ9D4C6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrp2bpQ9D4C6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms