Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spns3Q9D232 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spns3Q9D232 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms