Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Serpinb3bQ9D1Q5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms