Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf138Q9CQE0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf138Q9CQE0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf138Q9CQE0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms