Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tsnaxip1Q99P25 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tsnaxip1Q99P25 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms