Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rnf17Q99MV7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Rnf17Q99MV7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms