Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlgn1Q99K10 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nlgn1Q99K10 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlgn1Q99K10 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms