Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Krcc1Q99JT5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krcc1Q99JT5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krcc1Q99JT5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krcc1Q99JT5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krcc1Q99JT5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krcc1Q99JT5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krcc1Q99JT5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krcc1Q99JT5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krcc1Q99JT5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krcc1Q99JT5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krcc1Q99JT5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms