Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rassf9Q8K342 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rassf9Q8K342 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms