Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc30Q8BVF4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc30Q8BVF4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms