Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M10.6Q85ZW5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M10.6Q85ZW5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M10.6Q85ZW5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M10.6Q85ZW5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms