Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ntf4Q80VU4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ntf4Q80VU4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ntf4Q80VU4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.4 ms