Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptx4Q6RUU0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptx4Q6RUU0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms