Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Neil2Q6R2P8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil2Q6R2P8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms