Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med16Q6PGF3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Med16Q6PGF3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms