Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ggnbp1Q6K1E7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ggnbp1Q6K1E7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ggnbp1Q6K1E7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms