Protein–RNA interactions for Protein: Q6A098

Secisbp2l, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Secisbp2lQ6A098 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Secisbp2lQ6A098 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Secisbp2lQ6A098 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Secisbp2lQ6A098 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Secisbp2lQ6A098 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Secisbp2lQ6A098 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Secisbp2lQ6A098 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms