Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mre11Q61216 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms