Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc125Q5U465 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc125Q5U465 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc125Q5U465 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241.6 ms