Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm906Q3V0M1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm906Q3V0M1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms