Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl4Q3URY0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl4Q3URY0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms