Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brf2Q3UAW9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brf2Q3UAW9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms