Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rufy4Q3TYX8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy4Q3TYX8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.2 ms