Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CiartQ3TQ03 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms