Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MitfQ08874 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MitfQ08874 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MitfQ08874 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MitfQ08874 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MitfQ08874 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MitfQ08874 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MitfQ08874 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MitfQ08874 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 345.8 ms