Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Caprin2Q05A80 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Caprin2Q05A80 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms