Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r236Q05A06 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r236Q05A06 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r236Q05A06 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms