Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psen1P49769 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psen1P49769 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psen1P49769 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms