Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox2P48432 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox2P48432 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox2P48432 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox2P48432 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox2P48432 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms