Protein–RNA interactions for Protein: P41272

Cd27, CD27 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd27P41272 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd27P41272 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd27P41272 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.4 ms