Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Acvr1P37172 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Acvr1P37172 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms