Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsx1P31315 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gsx1P31315 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms