Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kif3aP28741 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kif3aP28741 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms