Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf1aP25118 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfrsf1aP25118 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfrsf1aP25118 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnfrsf1aP25118 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfrsf1aP25118 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms