Protein–RNA interactions for Protein: P16675

Ctsa, Lysosomal protective protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsaP16675 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsaP16675 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtsaP16675 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms