Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Parp2O88554 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Parp2O88554 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp2O88554 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Parp2O88554 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp2O88554 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp2O88554 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp2O88554 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp2O88554 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp2O88554 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms