Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vamp4O70480 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vamp4O70480 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vamp4O70480 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms