Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efna3O08545 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efna3O08545 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna3O08545 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms