Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IfnabL7MTU6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IfnabL7MTU6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IfnabL7MTU6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms