Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4aF8VPX6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4aF8VPX6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Speer4aF8VPX6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms