Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rfx7F8VPJ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rfx7F8VPJ6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms