Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Cdh18E9Q9Q6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Cdh18E9Q9Q6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Cdh18E9Q9Q6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Cdh18E9Q9Q6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Cdh18E9Q9Q6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Cdh18E9Q9Q6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Cdh18E9Q9Q6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Cdh18E9Q9Q6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Cdh18E9Q9Q6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cdh18E9Q9Q6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Cdh18E9Q9Q6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Cdh18E9Q9Q6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cdh18E9Q9Q6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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