Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacna1iE9Q7P2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1iE9Q7P2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms