Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm4491E0CX42 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm4491E0CX42 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm4491E0CX42 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Gm4491E0CX42 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm4491E0CX42 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Gm4491E0CX42 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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