Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Catsperg2C6KI89 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Catsperg2C6KI89 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Catsperg2C6KI89 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms