Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Brpf1B2RRD7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Brpf1B2RRD7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Brpf1B2RRD7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms